180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3531 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 399 aa  775    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  46.5 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  46.57 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 423 aa  275  8e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  26.82 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  26.54 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0694  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.794303  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  23.81 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  27 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  26.91 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1472  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3259  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867581 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 459 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.95 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2142  major facilitator superfamily transporter  21.84 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.85 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0573  glycerol-3-phosphatase transporter  23.91 
 
 		 459 aa  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 421 aa  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.34 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.57 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.39 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  33.59 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  28.99 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  26.3 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 564 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 478 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 478 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.62 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.41 
 
 		 534 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  29.39 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.28 
 
 		 508 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.56 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>