178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1472 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1472  major facilitator transporter  100 
 
 
458 aa  879    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302932  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0694  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 
415 aa  219  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.794303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  24.74 
 
 
459 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  24.05 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  34.18 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  34.18 
 
 
420 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  26.49 
 
 
418 aa  60.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.94 
 
 
439 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.94 
 
 
439 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.94 
 
 
439 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
394 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.03 
 
 
439 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  27.32 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  25.94 
 
 
491 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
394 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  29.38 
 
 
420 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  33.53 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  35.29 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  24 
 
 
440 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
390 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  35.29 
 
 
417 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.62 
 
 
439 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 
420 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  35.71 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.94 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  31.71 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  24.3 
 
 
406 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  24.77 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  33.82 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0640  major facilitator transporter  27.45 
 
 
425 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  21.14 
 
 
423 aa  51.2  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 
402 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  31.03 
 
 
416 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  24.62 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  31.55 
 
 
418 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  32.52 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  28.4 
 
 
436 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  28.85 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  26.88 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  23.9 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.89 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  26.93 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  29.93 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  29.44 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  27.35 
 
 
485 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  27.17 
 
 
463 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  22.92 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  29.93 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  25.14 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  22.76 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  30.34 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  28.82 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  22.69 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  29.07 
 
 
527 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  28.44 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  25.57 
 
 
434 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.63 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  25 
 
 
408 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  30 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  26.87 
 
 
434 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  30 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  30 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.15 
 
 
423 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  27.87 
 
 
426 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  32.62 
 
 
416 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  27.87 
 
 
426 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
403 aa  47.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  30.56 
 
 
425 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  26.15 
 
 
423 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  34.18 
 
 
422 aa  47  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  29.66 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  25.13 
 
 
433 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  30.22 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  25.51 
 
 
452 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  26.01 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1697  major facilitator transporter  23.25 
 
 
462 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  23.37 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  25.19 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  24.29 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  30 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  22.05 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  29.52 
 
 
482 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  30 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  26.24 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  23.58 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  23.58 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  23.81 
 
 
436 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>