More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2861 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  41.15 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  38.68 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  41.56 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  38.02 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  35.14 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  39.26 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  36.21 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  36.8 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  38.5 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  36.03 
 
 		 258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  35.54 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  32.38 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  35.39 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  34.24 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  33.17 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  30.29 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.86 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 324 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 280 aa  95.1  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 308 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  36.45 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  30.51 
 
 		 290 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  29 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  29 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  29 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  29 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  29 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  32.93 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  32.54 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.5 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.63 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.18 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  29.88 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  26.94 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>