More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2702 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  100 
 
 		 824 aa  1629    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.21 
 
 		 988 aa  664    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  63.38 
 
 		 808 aa  986    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.31 
 
 		 799 aa  922    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.9 
 
 		 791 aa  966    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  43.22 
 
 		 760 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  43.23 
 
 		 727 aa  524  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  52.5 
 
 		 729 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.19 
 
 		 662 aa  483  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  51.48 
 
 		 712 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  49.53 
 
 		 723 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  47.26 
 
 		 693 aa  463  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.97 
 
 		 747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.8 
 
 		 747 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  46.5 
 
 		 799 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.95 
 
 		 739 aa  445  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 		 746 aa  446  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.46 
 
 		 751 aa  436  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.22 
 
 		 709 aa  429  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  46.15 
 
 		 726 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.78 
 
 		 694 aa  391  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.94 
 
 		 707 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.41 
 
 		 707 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.1 
 
 		 707 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.81 
 
 		 756 aa  372  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.02 
 
 		 708 aa  372  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.86 
 
 		 706 aa  365  1e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.98 
 
 		 710 aa  360  6e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.66 
 
 		 729 aa  344  5e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.55 
 
 		 715 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.69 
 
 		 700 aa  317  7e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.65 
 
 		 1265 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.59 
 
 		 780 aa  248  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.43 
 
 		 800 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.48 
 
 		 785 aa  230  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.69 
 
 		 807 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.76 
 
 		 803 aa  221  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  31.09 
 
 		 874 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  30.11 
 
 		 901 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.81 
 
 		 816 aa  174  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  33.42 
 
 		 903 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  30.17 
 
 		 1060 aa  172  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.49 
 
 		 820 aa  172  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  28.57 
 
 		 2189 aa  171  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.37 
 
 		 1004 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.05 
 
 		 1004 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  26.35 
 
 		 1942 aa  169  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  28.39 
 
 		 2015 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.2 
 
 		 825 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.91 
 
 		 952 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  29.28 
 
 		 1767 aa  164  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.05 
 
 		 1230 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  30.24 
 
 		 1055 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.3 
 
 		 1318 aa  162  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.37 
 
 		 810 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 811 aa  157  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.44 
 
 		 695 aa  157  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 811 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  27.21 
 
 		 2157 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.29 
 
 		 697 aa  154  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  30 
 
 		 2208 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  28.6 
 
 		 825 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  29.93 
 
 		 893 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.7 
 
 		 727 aa  151  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  30.81 
 
 		 924 aa  151  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  27.95 
 
 		 2152 aa  150  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.74 
 
 		 699 aa  150  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.32 
 
 		 688 aa  150  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  30.9 
 
 		 701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  31.78 
 
 		 926 aa  148  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.49 
 
 		 667 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  28.43 
 
 		 2111 aa  148  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  29.25 
 
 		 905 aa  148  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  27.89 
 
 		 1465 aa  147  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  30 
 
 		 904 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  30.72 
 
 		 919 aa  147  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.25 
 
 		 811 aa  146  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  30.34 
 
 		 890 aa  146  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.4 
 
 		 845 aa  146  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.49 
 
 		 669 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  31.05 
 
 		 924 aa  144  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.35 
 
 		 889 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.4 
 
 		 927 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  31.02 
 
 		 909 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 817 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.53 
 
 		 762 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  30.15 
 
 		 927 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  33.09 
 
 		 402 aa  142  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 921 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  31.67 
 
 		 924 aa  141  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.57 
 
 		 684 aa  141  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.25 
 
 		 894 aa  140  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  29.58 
 
 		 908 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  31.03 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  27.61 
 
 		 1710 aa  139  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.73 
 
 		 996 aa  138  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  28.71 
 
 		 872 aa  137  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.01 
 
 		 951 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.68 
 
 		 861 aa  137  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  29.27 
 
 		 908 aa  137  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>