More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1810 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  100 
 
 		 500 aa  1000    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  59.66 
 
 		 497 aa  594  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  59.27 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  56.11 
 
 		 514 aa  568  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  57.53 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  41.97 
 
 		 467 aa  351  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  39.34 
 
 		 497 aa  316  5e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  40.27 
 
 		 642 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  41.67 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  40.96 
 
 		 481 aa  279  7e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  37.81 
 
 		 483 aa  279  9e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  42.52 
 
 		 451 aa  276  8e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  40.47 
 
 		 476 aa  264  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  38.54 
 
 		 437 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  35.87 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  34.94 
 
 		 484 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  34.11 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  34.13 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  33.95 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  33.72 
 
 		 484 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  34.82 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  34.72 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  35 
 
 		 422 aa  194  4e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  33.06 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  34.52 
 
 		 418 aa  173  6.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  31.04 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  30.5 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  28.17 
 
 		 385 aa  156  9e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  23.67 
 
 		 892 aa  120  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  27.92 
 
 		 1001 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  24.68 
 
 		 498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  32.06 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  28.95 
 
 		 1092 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  31.68 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  33.61 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  31.58 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  34.4 
 
 		 325 aa  99.8  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  27.43 
 
 		 764 aa  98.2  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  31.16 
 
 		 348 aa  97.8  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  31.8 
 
 		 326 aa  96.3  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  32.26 
 
 		 328 aa  96.3  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  32.26 
 
 		 329 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  31.34 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  30.84 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  30.6 
 
 		 315 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  27.9 
 
 		 398 aa  90.5  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  30.17 
 
 		 315 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  31.25 
 
 		 330 aa  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  29.36 
 
 		 326 aa  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  29.74 
 
 		 315 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  28.44 
 
 		 349 aa  86.7  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  27.19 
 
 		 942 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  30.57 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.25 
 
 		 289 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  29.36 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  26.58 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  27.35 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  29.44 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  26.46 
 
 		 993 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  29.13 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  26.11 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  24.48 
 
 		 571 aa  77  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  28.14 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  26.46 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  27.27 
 
 		 334 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  27.68 
 
 		 332 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  29.02 
 
 		 322 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  26.96 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  28.18 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  29.26 
 
 		 322 aa  73.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  28.31 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  27.31 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  30.86 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  28.99 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  26.52 
 
 		 369 aa  72  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1507  DNA-directed DNA polymerase  27.8 
 
 		 699 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  28.31 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  31.05 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  29.86 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  26.73 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  24.68 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.55 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  27.48 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.25 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  32.5 
 
 		 940 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  25.76 
 
 		 1015 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  23.4 
 
 		 725 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  25 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  25.59 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  27.35 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8086  predicted protein  32.41 
 
 		 114 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  28.34 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.38 
 
 		 735 aa  61.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  29.75 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.52 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  26 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.72 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1825  recombination factor protein RarA  21.98 
 
 		 394 aa  57  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.83 
 
 		 634 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.720575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>