More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2863 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2863  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
422 aa  861    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
662 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  31.05 
 
 
542 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
653 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  36.05 
 
 
998 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  28.84 
 
 
400 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
917 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
970 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
399 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
557 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
785 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  37.28 
 
 
554 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  29.55 
 
 
398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
575 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
796 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  33.79 
 
 
910 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
1214 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
791 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  38.33 
 
 
1200 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  26.94 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  27.67 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
569 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
927 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
977 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
579 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
858 aa  137  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
1237 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  34.96 
 
 
792 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
1201 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
803 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
633 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 
1550 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
798 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3020  histidine kinase  33.94 
 
 
631 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1022 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
1816 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  33.94 
 
 
565 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
1143 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
641 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1352 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5440  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235159  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  35.24 
 
 
603 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
603 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0968  histidine kinase  35.37 
 
 
318 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148974  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  35.98 
 
 
1278 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
2099 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1168 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0930  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  33.05 
 
 
745 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.407663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1003 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
767 aa  130  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
1917 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  36.82 
 
 
1170 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.44 
 
 
1046 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
2099 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
574 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  37 
 
 
1172 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
765 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
1857 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
1942 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  34.57 
 
 
810 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
1145 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
1839 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
1165 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
1135 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1203 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
1964 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
975 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1792 aa  126  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
1406 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  32.42 
 
 
710 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
1392 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  34.43 
 
 
1077 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
1163 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  26.57 
 
 
401 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
631 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
1937 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1161 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
442 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
573 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1303 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  31.56 
 
 
1196 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  34.16 
 
 
1695 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
442 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
646 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1479 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1936 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 
968 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1141 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1400 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1410 aa  124  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  39.39 
 
 
343 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  30.74 
 
 
560 aa  123  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
984 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
984 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1713 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
1406 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>