More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1720 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  100 
 
 
342 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  57.14 
 
 
355 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  55.22 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  56.94 
 
 
352 aa  349  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  54.35 
 
 
342 aa  348  8e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  47.81 
 
 
363 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  48.21 
 
 
350 aa  293  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  51.62 
 
 
349 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  51.62 
 
 
349 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  51.62 
 
 
349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  48.18 
 
 
333 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  48.27 
 
 
352 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  46.02 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  47.35 
 
 
366 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  43.68 
 
 
384 aa  275  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  45.27 
 
 
378 aa  275  6e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  47.7 
 
 
353 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  48.83 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  46.25 
 
 
369 aa  271  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  44.25 
 
 
359 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  43.11 
 
 
342 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  47.77 
 
 
359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  46.18 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  48.84 
 
 
368 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  47.28 
 
 
342 aa  268  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  44.09 
 
 
357 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  49.13 
 
 
352 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  43.75 
 
 
369 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  45.62 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  47.77 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.62 
 
 
387 aa  264  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 
349 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  50.63 
 
 
357 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  41.86 
 
 
361 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  43.28 
 
 
342 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  46.76 
 
 
349 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  46.76 
 
 
349 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  45.69 
 
 
396 aa  262  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  46.76 
 
 
349 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  45.1 
 
 
347 aa  261  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  47.67 
 
 
354 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  45.21 
 
 
345 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  46.42 
 
 
349 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  45.6 
 
 
369 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  44.31 
 
 
368 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  44.88 
 
 
345 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  44.95 
 
 
369 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  44.48 
 
 
343 aa  259  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  42.86 
 
 
398 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 
369 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  44.61 
 
 
349 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  48.3 
 
 
355 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  44.61 
 
 
349 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  45.7 
 
 
389 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  45.93 
 
 
370 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.61 
 
 
349 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  46.51 
 
 
374 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.23 
 
 
377 aa  256  3e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  43.47 
 
 
349 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.21 
 
 
349 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  46 
 
 
349 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46 
 
 
349 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  45.73 
 
 
349 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.49 
 
 
370 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  43.45 
 
 
348 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  44.19 
 
 
355 aa  255  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  42.32 
 
 
378 aa  255  7e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  44.85 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  41.91 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  40.91 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.69 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2091  ABC transporter related  43.67 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
353 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4476  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  47.65 
 
 
380 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.041416 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
353 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4610  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  47.65 
 
 
380 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  0.957495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  44.98 
 
 
348 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  44.3 
 
 
350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  42.07 
 
 
361 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.85 
 
 
352 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  46.34 
 
 
360 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  46.34 
 
 
360 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
353 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 
343 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 
364 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  49.45 
 
 
345 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  51.22 
 
 
365 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  46.05 
 
 
349 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  39.47 
 
 
343 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  46.93 
 
 
364 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
349 aa  251  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 
350 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47 
 
 
354 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  46.74 
 
 
357 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  46.7 
 
 
351 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  44.61 
 
 
358 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  44.61 
 
 
358 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>