99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2718 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  100 
 
 
94 aa  192  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  54.35 
 
 
93 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  51.06 
 
 
94 aa  97.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  46.24 
 
 
94 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  49.44 
 
 
97 aa  90.9  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  46.24 
 
 
94 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.49 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  46.07 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.78 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.39 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  47.95 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  43.37 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  37.08 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  40.22 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  39.78 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  37.23 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  43.16 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  42.86 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.96 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  39.56 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.04 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.23 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  41.11 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  42.86 
 
 
91 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.22 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  38.46 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  40 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  38.2 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  34.78 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  48.65 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  37.36 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  37.08 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  39.78 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  31.46 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  36.26 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  34.78 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  35.87 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  35.87 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  35.87 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  34.78 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  36.96 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  38.04 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  38.37 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  37.21 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.82 
 
 
348 aa  53.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  40.58 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  32.97 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  39 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 
94 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  36.99 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  28.57 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  30.61 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.86 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  33 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  34.09 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  32.97 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  32.98 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  32.86 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  33 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  29.55 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.96 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  29.29 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.83 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  34.09 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  31.76 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 
91 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  31.82 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3627  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0782046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  32.18 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  30 
 
 
102 aa  40  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>