49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0087 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  100 
 
 
90 aa  183  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  44.93 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  44.62 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.39 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.39 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.38 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  48.39 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.39 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.77 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.58 
 
 
94 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  43.48 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  43.48 
 
 
94 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  46.3 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  40.58 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.54 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.67 
 
 
96 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.12 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  37.68 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  47.54 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  31.88 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  42.03 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  39.13 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  41.27 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  40 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  37.68 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  41.27 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  40.58 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  48.39 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  37.68 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  38.1 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  41.94 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.03 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  42.19 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  38.1 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  36.92 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  35.29 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  37.7 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  41.18 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.27 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  30.65 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  37.68 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  41.18 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  47.83 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  41.27 
 
 
91 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.1 
 
 
95 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  32.79 
 
 
101 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  44.9 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  42.37 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>