69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0006 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  100 
 
 
93 aa  194  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  54.35 
 
 
93 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  45.65 
 
 
94 aa  84.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  41.3 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  42.39 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  47.31 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0044  hypothetical protein  76 
 
 
64 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.203145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.48 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  41.3 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  41.3 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.24 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  44.05 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  41.3 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  46.24 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.09 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  44.21 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.01 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  38.71 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  40.86 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  41.94 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.62 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  44.57 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  43.48 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  43.48 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  40.86 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  37.63 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  45.95 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  39.78 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  35.87 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  39.56 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  37.36 
 
 
97 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.24 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  39.18 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  37.63 
 
 
94 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  38.67 
 
 
91 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 
99 aa  53.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  34.04 
 
 
98 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  35.48 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  43.62 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  39.18 
 
 
98 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 
102 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  36.56 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  41.33 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  35.48 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.98 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  30.11 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  39.39 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  52.08 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 
94 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.53 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 
348 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  38.2 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>