64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2606 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 95 aa  190  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.33 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  40.96 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  37.21 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  43.37 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.88 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  40.96 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  41.18 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  44.05 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  40.48 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  45.57 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  41.67 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  42.17 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  40.91 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  30.68 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  42.86 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.29 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.64 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  41.57 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.35 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.36 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  38.64 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.24 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  40 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  39.33 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  44.83 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  44.83 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  58.14 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  45.16 
 
 		 348 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  35.23 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  37.65 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3627  plasmid stabilization system protein  33.77 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0782046  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  34.48 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  38.64 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  41.38 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  30.95 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  38.2 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  33.71 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  38.55 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.35 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  30.49 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  35.96 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  40 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  32.95 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  38.1 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  29.76 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  29.76 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.03 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  28.41 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  34.48 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 		 97 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>