32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03524 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 348 aa  690    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  46.27 
 
 		 94 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  49.25 
 
 		 93 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  48.33 
 
 		 94 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  43.75 
 
 		 94 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  44.26 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  46.67 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  40.3 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  43.33 
 
 		 95 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  40.32 
 
 		 97 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.79 
 
 		 97 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  45.31 
 
 		 94 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  38.81 
 
 		 96 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  35.82 
 
 		 94 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  43.28 
 
 		 93 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  45.16 
 
 		 95 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  49.02 
 
 		 91 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  22.76 
 
 		 2449 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.26 
 
 		 94 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.21 
 
 		 95 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 		 156 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  43.94 
 
 		 92 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  34.33 
 
 		 100 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  43.28 
 
 		 93 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  40.3 
 
 		 94 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  46.77 
 
 		 99 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  46.55 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  35.82 
 
 		 91 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  38.57 
 
 		 92 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  46.15 
 
 		 92 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.06 
 
 		 94 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  38 
 
 		 96 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>