82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2238 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  100 
 
 
95 aa  188  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  84.21 
 
 
96 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  72.04 
 
 
94 aa  137  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  80.77 
 
 
79 aa  133  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  72.34 
 
 
95 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  67.05 
 
 
91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  60.67 
 
 
101 aa  113  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  51.65 
 
 
93 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  57.95 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  54.55 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  48.86 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  45.26 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  43.96 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  43.18 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  46.67 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  52.17 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  52.17 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.05 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.05 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.05 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  40.45 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  41.05 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  43.18 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.05 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.09 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.94 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  44.94 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  44.94 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  51.11 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  47.3 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  40.91 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.49 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  43.75 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  44.32 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  37.08 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  42.22 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  41.94 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  38.2 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  39.08 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  38.2 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  41.3 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  40.91 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  37.08 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  37.08 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.94 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  40 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  37.63 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  42.11 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  36.56 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.36 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  42.67 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 
99 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.37 
 
 
100 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.05 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1400  hypothetical protein  44.83 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666984  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  31.11 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.02 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  42.19 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  35.96 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  39.13 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.89 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  34.94 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  28.26 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  38.95 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  34.57 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.82 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  30.38 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  30.34 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  30.12 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>