71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3831 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
99 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  38.82 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  36.56 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.78 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  35.48 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  31.87 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  36.47 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.04 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  30.11 
 
 
93 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.04 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.04 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.96 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  31.18 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.04 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  34.04 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
92 aa  52  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  34.88 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  38.71 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.41 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  31.87 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  35.29 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  33.68 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  32.97 
 
 
95 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  34.44 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.18 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  31.18 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  29.03 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  35.87 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  30.43 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 
94 aa  48.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  29.03 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  30.11 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.43 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.55 
 
 
103 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  28.72 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  27.96 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  29.33 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  32.99 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  30.43 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  27.96 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.72 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2757  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1314  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  36.92 
 
 
90 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2059  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0175569  normal  0.0247897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2829  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.73 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  26.88 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  28.72 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  28.72 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  41.82 
 
 
94 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  25.26 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  31.17 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.96 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  45.95 
 
 
348 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  35.59 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  26.6 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  25 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0606  plasmid stabilization system  29.21 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  23.66 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>