61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2216 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  39.18 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  31.91 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  39.58 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  36.56 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  30.3 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  34.09 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  35.8 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3886  plasmid stabilization system protein  40.45 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  37.63 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  37.08 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  35.79 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  31.91 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.95 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0773  plasmid stabilization system protein  38.75 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.87 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 107 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.11 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  31.68 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  37.5 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  34.48 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  25.61 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0151  hypothetical protein  32.26 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000158576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  31.82 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  30.59 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  31.18 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  30.59 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  29.27 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.89 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  29.7 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  38.1 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  35.63 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  31.76 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  28.05 
 
 		 93 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  30 
 
 		 103 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  35.79 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  28.09 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2829  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2757  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  28.87 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2059  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0175569  normal  0.0247897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1314  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  31.91 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  27.88 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.18 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 94 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  30.23 
 
 		 94 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>