20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4792 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  100 
 
 		 104 aa  207  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  42.39 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  37.5 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  29.35 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  29.35 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  38.1 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  33.67 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  30.23 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  29 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  39.53 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  29.17 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  33.71 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  32.88 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  36.36 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  30.85 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  29.59 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>