53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3207 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  100 
 
 
114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  37.5 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  36.84 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  34.38 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  34.38 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.31 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.55 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.51 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  37.62 
 
 
97 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  32.35 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  30.93 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  31.13 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  32.98 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3026  plasmid stabilization system  28.16 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.11 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  29.25 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  31.03 
 
 
101 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  30.23 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  31.31 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  31.11 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2885  plasmid stabilization system protein  34.18 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315603  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  32.29 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  26.83 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  26.8 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  26.8 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  30.59 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  35.05 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  34.09 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03820  Plasmid stabilisation system protein  29.41 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2829  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2757  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2059  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0175569  normal  0.0247897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1314  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  32.14 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  27.36 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  22.55 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  29.76 
 
 
97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  29.25 
 
 
107 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1660  hypothetical protein  26.85 
 
 
200 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.067401  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  28.12 
 
 
89 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  32.26 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  27.55 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  28.95 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  28.43 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4905  hypothetical protein  28.57 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  32.18 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2126  plasmid stabilization system protein  24.53 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  0.081563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  27.91 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  37.04 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>