78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_B2801 on replicon NC_007615
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
114 aa  236  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  44.79 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  43.96 
 
 
96 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  41.94 
 
 
99 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  41.41 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  46.74 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  36 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  37.36 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  40.22 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  34.74 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  39.36 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  35.79 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  38.04 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  37.37 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  40.62 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  40.91 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  40.91 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  35.05 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  34.02 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  34 
 
 
102 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  32.18 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  32.29 
 
 
96 aa  58.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  30.3 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  32.94 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  28.87 
 
 
111 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  31.82 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  30.85 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  31.03 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  28.57 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  36.76 
 
 
104 aa  48.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  29.79 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  32.22 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  30.23 
 
 
97 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 
98 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  29.7 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  29.47 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  29.47 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  27.06 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  27.06 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  25.22 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3062  plasmid stabilization system protein  27.12 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  27.08 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  28.92 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2491  plasmid stabilization system  25.81 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  28.89 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  32.18 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  32.38 
 
 
703 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 
93 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  27.88 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  25 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  27.37 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  31.43 
 
 
655 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  37.04 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
98 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  30 
 
 
90 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>