47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4802 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  100 
 
 		 96 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  52.13 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  36.84 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  35.8 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  42.22 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  38.55 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  35.05 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.55 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.68 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  29.79 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  31.11 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.61 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0151  hypothetical protein  30.69 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000158576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  35.96 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.88 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  37.63 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0773  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  39.56 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  27.08 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  29.41 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  37.5 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  25.26 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  39.29 
 
 		 100 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  31.76 
 
 		 94 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  32.89 
 
 		 94 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  32.63 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  28.74 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  24.73 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  37.21 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  27.91 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  24.71 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  24.71 
 
 		 103 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  24.71 
 
 		 103 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>