100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1424 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 98 aa  199  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  67.71 
 
 		 98 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  45.05 
 
 		 95 aa  95.9  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  46.15 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  39.18 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  44.09 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  40.23 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  42.7 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.89 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  38.55 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  35.96 
 
 		 100 aa  67  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  36.46 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  33.71 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  34.83 
 
 		 100 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  35.96 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  33.72 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  35.29 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  36.96 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0926  prophage LambdaSa04, RelE/ParE family protein  38.54 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  31.76 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.09 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0164  plasmid stabilization system  27.38 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000911041  unclonable  6.83121e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  35.53 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.95 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  38.96 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  37.5 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  36 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.11 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.11 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.11 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  35.11 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  31.91 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  29.17 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.38 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  32.18 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  35.63 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  32.43 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.53 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  32.88 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.96 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  30.11 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2487  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000234328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  35.05 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  31.58 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  39.06 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  32 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  36.14 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.52 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  35.48 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  33.67 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  29.89 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.68 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  27.96 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  29.67 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  32.29 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  30.11 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.67 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3885  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.68 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0194678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0407  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0416  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  28.09 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  33.71 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  29.35 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  25.84 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  32.26 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0815  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000215644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  26.97 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.67 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  25.84 
 
 		 91 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1406  hypothetical protein  36.54 
 
 		 60 aa  40  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00275474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  31.91 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  26.09 
 
 		 93 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  32.05 
 
 		 79 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>