18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4865 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  201  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  55.88 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  59.6 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  39.18 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  35.05 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  29.47 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  35.05 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3886  plasmid stabilization system protein  31.31 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  34.34 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  29.17 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  27.91 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  37.14 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  31.31 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  26.74 
 
 		 99 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 101 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 101 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>