36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6566 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  100 
 
 		 103 aa  204  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  55.88 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  56 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  29.67 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  33.66 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3886  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  31.68 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  29.03 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  29.03 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  27.96 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  39.13 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.26 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  26.32 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  34.74 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  30.21 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  34.04 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  24 
 
 		 97 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2059  plasmid stabilization system protein  33 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0175569  normal  0.0247897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1314  plasmid stabilization system protein  33 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2757  plasmid stabilization system protein  33 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2829  plasmid stabilization system protein  33 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.43 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  33.68 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  36.46 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  31.18 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  29.79 
 
 		 94 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.79 
 
 		 94 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.79 
 
 		 94 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.79 
 
 		 94 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>