22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4629 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 112 aa  220  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  59.6 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  56 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  39.58 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3886  plasmid stabilization system protein  36.11 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  35.42 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  33.67 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  32.29 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.1 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  32.29 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  36.63 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  27.66 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  40.28 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  30.61 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  32.11 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  29.81 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>