65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0457 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  100 
 
 		 108 aa  216  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  57.41 
 
 		 110 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  53.27 
 
 		 109 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  53.7 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  53.7 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  50.47 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.27 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  36.54 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  34.95 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.14 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  31.13 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  31 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  31 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  31.31 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  30.61 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  31.07 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  28 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  31 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.65 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  33.33 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  33.7 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  33.7 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  35.11 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  30.3 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  27 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.85 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  34.88 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  31.96 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  26.42 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  26.42 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  30 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.83 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  32.5 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2342  hypothetical protein  27 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.441913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  31.96 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.56 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  27.84 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  31.11 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  31.96 
 
 		 103 aa  43.9  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  31.63 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0164  plasmid stabilization system  23.53 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000911041  unclonable  6.83121e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  31.52 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  29.29 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  32.97 
 
 		 90 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  29.81 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  31.76 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  24.72 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.23 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  34.67 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>