58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3467 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  62.24 
 
 		 102 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  59.38 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  57.14 
 
 		 97 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  39.8 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  41.05 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  42 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  42 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.87 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  37.78 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.52 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  35.71 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  35.79 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  35.79 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  34.07 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.87 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  36.78 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  28.87 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  35.35 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  33.72 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.93 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.02 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  29.79 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  24.14 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  24.14 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  34.94 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  25.53 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  32.43 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.99 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.99 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  29.55 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  27.84 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  32.99 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.99 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.11 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  27.84 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  27.66 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  27.66 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  33 
 
 		 106 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  30.53 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.61 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  27.71 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  29.59 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 		 100 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 96 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>