42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3420 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  69.39 
 
 		 103 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  62.37 
 
 		 100 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  59.14 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  40.22 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  39.13 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  38.04 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  35.11 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  41.03 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  36.96 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  34.02 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  42.39 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  31 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  35.05 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  35.96 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  35.48 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  40.74 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  27.91 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.77 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  31.96 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  34.48 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  31.52 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  29.35 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  29.03 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  31.65 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  39.68 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  28.87 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  28 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  28.89 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  25.26 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  26.09 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>