53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1043 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  100 
 
 		 109 aa  220  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  75 
 
 		 109 aa  168  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  57.41 
 
 		 110 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  56.88 
 
 		 109 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  53.7 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  52.78 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  46.73 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  38.68 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  37.14 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  34.31 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  34.34 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.11 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  34.34 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  35.35 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  37.25 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  32.32 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  31.63 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.48 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  29.25 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  29.25 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  40.2 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  39.22 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  31.96 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.73 
 
 		 103 aa  48.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  31.17 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  31.4 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2342  hypothetical protein  32 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.441913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  33 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  31.17 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  33.75 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  32.73 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2238  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  26.21 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  29.7 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  32.67 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2205  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.32 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000157964  hitchhiker  0.00000000176055 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0124  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 108 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.16771e-22 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  28.87 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  29.9 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>