57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0836 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  100 
 
 		 104 aa  207  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  66.34 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  54.26 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  40.43 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  38.71 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  38.71 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  43.04 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  40.66 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.3 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  37.08 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  36.96 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  37.93 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  34.69 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  36.71 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  30.3 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  35.23 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  31.03 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  31.68 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  30 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.35 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  27.47 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  30.38 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  28.71 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1406  hypothetical protein  43.4 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00275474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  26.14 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  27.27 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  25.81 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  28.09 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  23.08 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.93 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  28.16 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  30 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  26.32 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  24.73 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  29.55 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  26.14 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 98 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  30 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  25 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.85 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2487  plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000234328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.26 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.26 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.26 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  28.26 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 94 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>