88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2119 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 98 aa  200  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  67.71 
 
 		 98 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  46.88 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  44.79 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  36.46 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  34.02 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  38.04 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  36.67 
 
 		 96 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  37.08 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  39.77 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  37.63 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.08 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  32.22 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  34.88 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  40.26 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  36.78 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  31.11 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  32.61 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0164  plasmid stabilization system  29.76 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000911041  unclonable  6.83121e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  32.53 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.67 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  32.88 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  28.89 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.63 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  31.76 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.95 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  31.03 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  34.12 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  29.03 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.11 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.53 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.53 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  30.53 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.53 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.68 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  32.5 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  30.14 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.58 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2487  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000234328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2332  plasmid stabilization system protein  37.84 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  31.52 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  32.43 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  32 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  32.81 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  28.09 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.03 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  29.17 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  26.97 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0407  hypothetical protein  35.35 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  31.88 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  33.68 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0416  hypothetical protein  35.35 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  27.96 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.63 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  32.95 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  27.47 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  33.71 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  23.6 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  31.25 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  23.6 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  23.6 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  23.6 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  28.89 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  26.97 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  33.33 
 
 		 73 aa  40  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>