46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2911 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  100 
 
 
97 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  75.79 
 
 
96 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  75.79 
 
 
96 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  52.63 
 
 
95 aa  120  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  55.21 
 
 
96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  44.09 
 
 
104 aa  90.5  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  42.55 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 
98 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.04 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  30.21 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  34.07 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  28.87 
 
 
110 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  33.71 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  31.11 
 
 
95 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  30.43 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  31.58 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  32.29 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  34.44 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  28.57 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
94 aa  48.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  31 
 
 
101 aa  48.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  29 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  29.76 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  35.87 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0926  prophage LambdaSa04, RelE/ParE family protein  30.61 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  32.05 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  26.44 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  29.73 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  27.47 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  29.35 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  30.49 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  27.37 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 
100 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.71 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  25.3 
 
 
98 aa  40.8  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  32.18 
 
 
94 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>