32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1318 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  64.94 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  36.96 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  40.26 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  38.16 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  38.16 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  37.36 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  36 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.93 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.64 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  31.11 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  29.73 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  35.53 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.93 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  36.99 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.93 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.93 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  30.93 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  26.09 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0357  plasmid stabilization system protein  38.36 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00455292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  35.14 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  31.58 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  27.27 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  32 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  35.14 
 
 		 104 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  34.62 
 
 		 109 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.93 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  32.5 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  32.88 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>