68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0957 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  222  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  75 
 
 
109 aa  168  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  57.01 
 
 
109 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  52.78 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  50 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  52.78 
 
 
108 aa  120  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  45.79 
 
 
108 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  36.79 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  36.45 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.05 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.67 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  33.01 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  30.1 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  34.31 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  30.61 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  31.31 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  31.31 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.5 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  29 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  35.05 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  35.29 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  29 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  32.26 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  32.26 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  36.26 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  29.59 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.96 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  35.23 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  32.26 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  27 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  30.93 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  28.04 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  28.04 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  28.87 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  50 
 
 
102 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  30.93 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  34.83 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  32 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  27.37 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2238  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.16 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  33 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  30.61 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  31 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  22.34 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2342  hypothetical protein  27.78 
 
 
110 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.441913  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 
95 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  29 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  32.97 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  35 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  28.87 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  26.37 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0164  plasmid stabilization system  21.05 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000911041  unclonable  6.83121e-16 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  25.58 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  25.77 
 
 
94 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>