57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1487 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  51.4 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.79 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  36.79 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  38.1 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  38.68 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  33.64 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  34.95 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  36.19 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  39.05 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  42.2 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  34.62 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  37.23 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  28.97 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  28.97 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  36.17 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.01 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  35.05 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0926  prophage LambdaSa04, RelE/ParE family protein  36.25 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.52 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2205  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.78 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000157964  hitchhiker  0.00000000176055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  33.68 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  34.04 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  32.08 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  35.56 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  31.65 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  32.08 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  34.15 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  32 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0681  hypothetical protein  27.1 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0577  hypothetical protein  42.03 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000459224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  33 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  32.98 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3188  prophage LambdaSa04, RelE/ParE family protein  50 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2342  hypothetical protein  29.52 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.441913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0124  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.16771e-22 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1411  hypothetical protein  29.29 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0345542  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  27.27 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5833  plasmid stabilization system protein  30.48 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.24244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  29.25 
 
 		 114 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  25 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  32.11 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  29.13 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0241  hypothetical protein  28.16 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 103 aa  40  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  29.52 
 
 		 97 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>