50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0159 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  46.15 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  42.7 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  40.86 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  42.5 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  42.5 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  42.22 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  34.38 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  31.82 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.98 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  32.63 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  30.93 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  35.11 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  35.63 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.14 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  30.68 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  31.25 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  28.57 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  39.53 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0151  hypothetical protein  31 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000158576  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  29.27 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  35.9 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5181  plasmid stabilization system  38.71 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  32.58 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  29.55 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  31.82 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  30.56 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  25.56 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>