61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6084 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  78.79 
 
 		 99 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  48.42 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  47.87 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  50 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  48.91 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  42.55 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  47.87 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  43.48 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  39.56 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  42.7 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  40.22 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  33.7 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  37.89 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  36.17 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.85 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.85 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  39.33 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  34.78 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  33.7 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  35 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  35.42 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  37.08 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  36.56 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 		 98 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  26.6 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  27.72 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  31.11 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  35.23 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  30.43 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  34.86 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.17 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  30.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  33.94 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.17 
 
 		 93 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>