39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2850 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 121 aa  248  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  70.53 
 
 		 95 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  48.42 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  45.12 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  45.26 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  42.86 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  37.35 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  39.29 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  41.03 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  34.52 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  34.52 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  33.73 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  30 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  30.69 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  37.5 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  29.27 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  30.12 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  34.94 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  31.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  35.53 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  31.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  32.5 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.4 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  27.63 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  32.53 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  28.92 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  30.86 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.38 
 
 		 99 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  27.71 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>