54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0978 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 98 aa  203  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  95.92 
 
 		 98 aa  194  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  94.9 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  68.04 
 
 		 98 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  67.01 
 
 		 98 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  48.45 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  40.43 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  32.99 
 
 		 100 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  35.11 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  31.91 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  34.74 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.46 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  34.74 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  31.96 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  35.71 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  35.71 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  35.96 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  38.55 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  27.55 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  30.34 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  31.11 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  29 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  27.72 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  29.59 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  28.12 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  30.43 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  30.11 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  23.6 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  30.95 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  27.06 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  25.27 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  28.77 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>