20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2087 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 96 aa  196  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  34.78 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.41 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  28.75 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  34.18 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.06 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.06 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.06 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.06 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  30.23 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  27.27 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  27.78 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  26.32 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  30.95 
 
 		 99 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 97 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>