50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2374 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 98 aa  204  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  98.98 
 
 		 98 aa  201  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  94.9 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  67.01 
 
 		 98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  65.98 
 
 		 98 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  48.45 
 
 		 98 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  40.43 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  36.17 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  30.85 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  36.17 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  32.26 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  34.04 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  30.21 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  30.77 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  36.17 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  35.63 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  27.08 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  31.52 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  29.35 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  28.71 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  30.11 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  27.06 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  27.37 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  25.27 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  32.95 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  25.56 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>