62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0286 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  100 
 
 		 100 aa  213  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  50 
 
 		 99 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  45.74 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  38.64 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  39.56 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  40.43 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  34.69 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  33.33 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  35.71 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  30.43 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  35.63 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  32.61 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  35.63 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  32.58 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  30.63 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  26.8 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  29.89 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  27.93 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  29.03 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  34.25 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.17 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  27.91 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  28.41 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  31.76 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3062  plasmid stabilization system protein  28.83 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  28.24 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  27.06 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  26.09 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  23.96 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  26.32 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>