30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3092 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  67.02 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  68.42 
 
 		 97 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  53.01 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  45.16 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  58.57 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  37.65 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  35.71 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  34.52 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  31.82 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  34.15 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  30.23 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  32.53 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  26.19 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  34.44 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  31.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  26.25 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  33.71 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  35.09 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  28.09 
 
 		 98 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  30.3 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 96 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>