59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1629 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  43.96 
 
 
114 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  43.18 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  37.36 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  39.33 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  36.47 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  31.03 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  33.33 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  30.77 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  32.97 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 
99 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  29.89 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  35.87 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  34.52 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  34.74 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  29.59 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 
94 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  32.26 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  27.59 
 
 
99 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  30.77 
 
 
99 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  30 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  28.75 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  30.93 
 
 
98 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  29.89 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  32.18 
 
 
111 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  30.85 
 
 
95 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  34.29 
 
 
104 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  31.65 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  31.33 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  32.94 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  30.85 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  27.66 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2491  plasmid stabilization system  28.09 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  26.88 
 
 
97 aa  43.5  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  27.27 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  28.41 
 
 
95 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  23.4 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  22.55 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  23.81 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 
93 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  27.27 
 
 
96 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  27.38 
 
 
99 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  25.27 
 
 
102 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  24.44 
 
 
112 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  24.14 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  26.6 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  28.72 
 
 
97 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>