52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0491 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  100 
 
 
93 aa  192  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  97.85 
 
 
93 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  51.06 
 
 
97 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  50 
 
 
97 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  44.68 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.37 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.29 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
98 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  36.05 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.29 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  30.53 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6084  plasmid stabilization system  35 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  32.65 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  37.78 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  33.7 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  32.61 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 
97 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  31.18 
 
 
98 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  34.12 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  34.12 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  30.53 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  33.68 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  29.09 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  28.09 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  31.87 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3885  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.76 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0194678  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1510  plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 
93 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.271641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 
96 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  32.95 
 
 
114 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  27.17 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  29.41 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>