27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4525 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  91.3 
 
 		 116 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3062  plasmid stabilization system protein  57.26 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3723  plasmid stabilization system  44.25 
 
 		 119 aa  93.6  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000315563  normal  0.426488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  28.07 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  27.93 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  29.36 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  28.32 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2982  hypothetical protein  62.86 
 
 		 45 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.521363  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  28.44 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  26.09 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.09 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  27.03 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  30.28 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  29.36 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  26.96 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  30.97 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  27.68 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  32.46 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  30.17 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.18 
 
 		 93 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  28.85 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  25.21 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  34.86 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  24.11 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  28.95 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>