68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11987 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  204  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  53.12 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  54.35 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  53.26 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  48.39 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  44.79 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  46.81 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  46.15 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  45.65 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  51.06 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  48.91 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  45.05 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  40.86 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  43.48 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  41.49 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  36.73 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  37.11 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  39.56 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  38.04 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  38.95 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  39.33 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  34.44 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  39.29 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  39.77 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  32.98 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  38.2 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  30.53 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  34.78 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  32.18 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 99 aa  50.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  31.52 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  30.43 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  30.21 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 103 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 103 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  34.25 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  36.11 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  31.51 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1047  plasmid stabilization system protein  37.14 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.786353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  30.43 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  30.43 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  27.68 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  34.74 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  27.68 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  30.85 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  29.59 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>