20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3065 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  78 
 
 		 102 aa  167  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  77 
 
 		 102 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  76 
 
 		 102 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  65.66 
 
 		 104 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  29.89 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  28.43 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  46.34 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  30.61 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  34.21 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>