59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1161 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  100 
 
 		 104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  54.64 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  42.7 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  41.24 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  34.38 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  39.33 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  35.11 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  32.26 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  38.2 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  34.44 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  36.26 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  36.67 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  35.35 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  35.23 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  37 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  32.98 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  35.96 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  31.37 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  26.8 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  29.81 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  28.16 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  28.43 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  28 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  27.47 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  28.89 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  28 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  32.22 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  27.78 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  26.6 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  26.6 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  28.28 
 
 		 96 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  25.21 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3723  plasmid stabilization system  25.66 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000315563  normal  0.426488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  25.69 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>