18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2662 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 104 aa  213  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  65.66 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  60.4 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  60.4 
 
 		 102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  56.44 
 
 		 102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  32.58 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 100 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  36.26 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  29.81 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  28.16 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  30.77 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  31.63 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  31.87 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>