23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1016 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2435  plasmid stabilization system protein  59.76 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  36.46 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  33.66 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  32.98 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  28.28 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  32.98 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  30.93 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  30.69 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  29.7 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1825  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  29.7 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  29.7 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3065  plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916838  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3809  hypothetical protein  36.08 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3497  plasmid stabilization system protein  36.73 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.664397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  28.71 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  27.27 
 
 		 100 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  34.78 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2662  plasmid stabilization system protein  31.63 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  24.73 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>