64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0900 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  100 
 
 		 99 aa  209  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  56.99 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  50 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  46.15 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  41.94 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  41.84 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  41.3 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  39.33 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  37.23 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  43.18 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  43.18 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  43.18 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  42.05 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  43.18 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  38.3 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  35.48 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  35.35 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  30.34 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0985  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  34.78 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  39.73 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  35.71 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  36.25 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  34.25 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  32.26 
 
 		 95 aa  50.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7135  hypothetical protein  33.71 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  26.8 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  29.21 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  29.21 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  35.48 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  33.87 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  37.1 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  31.82 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  28.44 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  26.8 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  30.86 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  26.8 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3062  plasmid stabilization system protein  29.73 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  26.36 
 
 		 116 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2435  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  27.03 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1016  plasmid stabilization system protein  24.73 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.767332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>